Хутора казаков станицы Усть-Лабинской при реке Кирпили известны с 1840-х годов. 19 октября 1879 года из этих хуторов был образован посёлок Кирпильский (неофициально назывался также Чернышовка). В 1906 году посёлок был преобразован в станицу Кирпильскую. По вероисповеданию коренные жители делились на православных и старообрядцев (потомки донских казаков).